2005 y.

Articles

  1. Miroshnychenko K.V., A.V. Shestopalova. Flexible docking of DNA fragments and actinocin derivatives // Molecular Simulation. – 2005. – V. 31. – N. 8. – P. 567–574.
  2. Круглова Е.Б., Ермак Е.Л., Волощук Т.П., Потопальский А.И., Потопальская Ю.А. Спектрофотометрическое исследование связывания берберина и амитозина с тимусной ДНК в присутствии этидиум бромида // Украинский биохимический журнал. – 2005. – Т.77. – № 4. – С. 74-80.
  3. Е.Б. Круглова, Н.А. Гладковская, В.Я. Малеев Использование метода спектрофотометрического анализа для вычисления термодинамических параметров связывания в системах актиноциновые производные-ДНК // Биофизика. – 2005. – Т. 50 – Вып.2. – С. 253-264.
  4. Круглова Е.Б., Больбух Т.В., Гладковская Н.А., Близнюк Ю.Н. Связывание антибиотиков актиноцинового ряда с матрицей полифосфата // “Біополімери і клітина”. – – Т.21. – №4. – С.358-364.
  5. Мележик Е.П., Семенов М.А., Иванов А.Ю.. Исследование тонкой структуры полосы амид I ИК-Фурье спектра коллагена. // Вісник ХНУ №665, “Біофізичний вісник”. – 2005. – Вып.1(15). – С. 62-67.
  6. Близнюк Ю.Н., Больбух Т.В., Круглова Е.Б., Семёнов М.А., Малеев В.Я. Исследование комплекса актиноцил-бис-(3-диметиламинопропил) амина ─ двуспиральная полирибоцитидиловая кислота по данным Раман спектроскопии и спектрофотометрии. Вісник ХНУ №665, “Біофізичний вісник” . – 2005. –Вып.1(15). – С. 29-34.
  7. О.В.Хорунжая, В.А.Кашпур, А.А.Красницкая, В.Я.Малеев. Влияние гамма излучения на гидратацию и структуру комплекса ДНК – кофеин. Вісник ХНУ №665, “Біофізичний вісник”. – –Вып.1(15). – С.68-72.
  8. Шестопалова А.В., Мирошниченко Е.В. Компьютерное моделирование комплексообразования производной актиноцина и двуспиральной полирибоцитидиловой кислоты // Вісник ХНУ №665, “Біофізичний вісник”. – 2005. – Вып.1(15). – С.57-62.
  9. Минакова Е.А., Будько Л.В., Близнюк Ю.Н., Круглова Е.Б. Изучение комплексообразования актиноциновых производных с ДНК методами спектрофотометрии и Раман спектроскопии. // “Вестник Сев. ГТУ”. Севастополь. – 2005. – 70 – C. 111-118.
  10. Малеев В.Я., Шестопалова А.В. Физические принципы молекулярной организации биополимеров // Радиофизика и электроника. – 2005. – Т.10, спец.впуск. – С. 677-699.
  11. Борискина Е.П., Больбух Т.В., Семенов М..А. Валентные колебания карбонильных групп в Раман спектрах коллагена и poly(Gly-Pro-Pro): расчет и эксперимент // Вісник ХНУ №716, “Біофізичний вісник”. –2005. –Вып. 2 (16). – С. 5-10.
  12. Гасан А.И., Малеев В.Я., Филипский А.В. Калориметрическое исследование термической устойчивости структурных элементов нуклеиновых кислот // Вісник ХНУ №665, “Біофізичний вісник”. – 2005. – Вып.1 (15). – С. 11-14.

Theses

  1. Bliznyuk Ju.N., Bolbukh T.V., Kruglova E.B. Raman spectroscopy and spectrophotometry investigation of actinocin derivatives interaction with polynucleotides. III International Conference “Physics of Liquid Matter: Modern Problems”, May 27-31, 2005, Kyiv, Ukraine, p.184.
  2. Shestopalova A.V. The investigation of the molecular mechanisms of the association of actinocin derivative and caffeine in aqueous solution: the molecular dynamics simulation //III Int.Conf. “Physics of Liquid Matter: Modern Problems”, May 27-31, 2005, Kyiv, Ukraine,р. 178.
  3. Miroshnychenko K.V., Shestopalova A.V. Computer simulation of target-ligand interactions // 1st Int.Symp.Methods and Applications of Computational Chemistry, 30 June-1July 2005, Kharkov,Ukraine, Books of Abs., p.54.
  4. Bliznyuk Ju.N., Bolbukh T.V., Kruglova E.B. Conformational changes of actinocin derivatives by the Raman spectroscopy and pH-metry. XVII International School-Seminar” Spectroscopy of Molecules and Crystals” 20.09-26.09.2005, Beregove, Crimea, Ukraine, p.37.
  5. Miroshnychenko K.V., Shestopalova A.V. Molecular dynamics simulation of single-stranded polyribocytidylic acid // XVII International School-Seminar” Spectroscopy of Molecules and Crystals” 20.09-26.09.2005, Beregove, Crimea, Ukraine, Book of Abs., p.208.
  6. Ermak E.L., Kruglova E.B. Spectrophotometric investigation of competitive binding of actinocine derivative ActII and 6-Azacytidine to DNA // Proc. Of the International School-Seminar Spectroscopy of Molecules and Crystals XVII ISSSMC. – Beregove, Ukraine. – 2005. – P.286.
  7. Kruglova E.B, Gladkovskaya N.А.The shift of the melting temperature of DNA-ligand complexes compared with melting temperature of “pure” DNA. XVII International School-Seminar” Spectroscopy of Molecules and Crystals” 20.09-26.09.2005, Beregove, Crimea, Ukraine, p.281.
  8. A. Gladkovskaya, E. B. Kruglova. The comparison of different calculation methods of the melting temperatures for DNA-ligand complexes. The International Biophysics Congress Montpellier, France 2005 IUPAB, 15th Congress and EBSA, 5th Congress.
  9. Ермак Е.Л., Круглова Е.Б. Связывание актиноцинового производного ActII с ДНК в присутствии бромистого этидиума и Хоехста 33258 // актуальные вопросы теоретической и прикладной физики и биофизики “Физика. Биофизика – 2005”. Севастополь, 4-9 апреля 2005 г., С. 62.
  10. Ермак Е.Л., Круглова Е.Б. конкурентное связывание актиноцинового производного ActIV этидиума бромида с ДНК // конференція молодих учених КМУ-ФНТ-2005. – Харків, Україна. – 2005. – С.35.
  11. Ermak E.L., Kruglova E.B. Investigation of competitive binding of biologically active ligands with calf thymus DNA in aqueous solution // 3rd International Conference Physics of Liquid Matter: Modern Problems PLM MP. – Kyiv, Ukraine. – 2005. – P.191.
  12. Круглова Е.Б., Ермак Е.Л., Волощук Т.П., Потопальский А.И., Потопальская Ю.А. Исследование взаимодействия модифицированного тиотэфом алкалоида чистотела большого амитозина1 с тимусной ДНК в присутствии окрашенных биологически активных меток // Міжнародний форум “Основи молекулярно-генетичного оздоровлення людини і довкілля”. Київ, Україна. – 2005. – С.105-108.
  13. Минакова Е.А., Будько Л.В., Близнюк Ю.Н. Изучение взаимодействия актиноциновых производных с ДНК методами спектрофотометрии и Раман спектроскопии. Всеукраинская науч.-технич. Конф. Мол. Ученых “Актуальные вопросы теор. И прикладн. Физ. И биофиз.”, Севастополь, 2005, с. 46.
  14. Будько Л.В., Близнюк Ю.Н. Исследование взаимодействия актиноциновых производных с ДНК методом Раман спектроскопии. Конференція молодих вчених “Фізика Низьких Температур (КМУ-ФНТ-2005)”, Харків 2005, с 35.
  15. Близнюк Ю.Н. Исследование комплексообразования актиноциновых производных с разной длиной боковых цепочек с ДНК методами Раман спектроскопии и спектрофотометрии в УФ и видимой области. // Тезисы докладов 5-й Харьковской конференции молодых ученых «Радиофизика и СВЧ Электроника», Харьков, 14-16 декабря 2005, с.46.
  16. Будько Л.В., Близнюк Ю.Н. Применение Раман спектроскопии для исследования комплексообразования этидиум бромида с ДНК. // Тезисы докладов 5-й Харьковской конференции молодых ученых «Радиофизика и СВЧ Электроника», Харьков, 14-16 декабря 2005, с. 47.
  17. Е.П. Борискина. Исследование межпептидной водородной связи в коллагеновых структурах. // Тезисы докладов 5-й Харьковской конференции молодых ученых «Радиофизика и СВЧ Электроника», Харьков, 14-16 декабря 2005, с. 55.
  18. Ермак Е.Л., Круглова Е.Б. Новые аспекты взаимодействия бромистого этидиума с тимусной ДНК. // Тезисы докладов 5-й Харьковской конференции молодых ученых «Радиофизика и СВЧ Электроника», Харьков, 14-16 декабря 2005, с. 48.
  19. Животова Е.Н., Духопельников Е.В. Исследование водных растворов оксиэтилированного глицерина (N=30) методами ДСК и ИК-спектроскопии. // Тезисы докладов 5-й Харьковской конференции молодых ученых «Радиофизика и СВЧ Электроника», Харьков, 14-16 декабря 2005, с. 48.
  20. Минакова Е.А., Круглова Е.Б. Расчетное и экспериментальное сравнение комплексообразования с молекулами ДНК актиноциновых производных с различным строением боковых цепей. // Тезисы докладов 5-й Харьковской конференции молодых ученых «Радиофизика и СВЧ Электроника», Харьков, 14-16 декабря 2005, с. 49.
  21. Мирошниченко Е.В., Шестопалова А.В. Расчет точечных зарядов на атомах двухзарядного катиона производной актиноцина Аct3 // Тезисы докладов 5-й Харьковской конференции молодых ученых «Радиофизика и СВЧ Электроника», Харьков, 14-16 декабря 2005, с. 50.
  22. Хребтова А.С. Исследование плавления комплексов ДНК с производным актиноцина Аct3 при различных соотношениях концентраций ДНК-лиганд. // Тезисы докладов 5-й Харьковской конференции молодых ученых «Радиофизика и СВЧ Электроника», Харьков, 14-16 декабря 2005, с. 53.

Synopsis

Духопельников Є.В. Молекулярні механізми взаємодії нових антибіотиків актиноцинового ряду з матрицями нуклеїнових кислот. – Автореферат дисертації на здобуття наукового ступеня канд. фіз.-мат. наук за спеціальністю 03.00.02 – біофізика. – Ротапринт ІРЕ ім. О.Я. Усикова НАН України, Харків, 2004. – 17 с.

2006 y.

Articles

  1. Шестопалова А.В. Компьютерное моделирование ассоциации кофеина и производных актиноцина в водных растворах // Биофизика, 2006, т.51, вып.3, с 389-401.
  2. Shestopalova A.V. The investigation of the association of caffeine and actinocin derivatives in aqueous solution: A molecular dynamics simulation // Journal of Molecular Liquids, 2006, v.127, N1-3, P.113-117.
  3. Шестопалова А.В. Компьютерное моделирование гидратации фрагментов различных структурных форм полирибоадениловой кислоты // Біофізичний вісник. – 2006. – вип.1(17). –  С.5-14.
  4. Шестопалова А.В., Больбух Т.В., Семенов М.А. Молекулярные механизмы взаимодействия кофеина с различными структурными формами полирибоадениловой кислоты: эксперимент и компьютерное моделирование // Біофізичний вісник. – 2006. – вип.1(17). –  С.24-35.
  5. Берест В.П., Малеев В.Я., Карпенко Н.О. Характеристика структурно-функціональних властивостей клітин крові тварин за різної тривалості опромінювання. // В кн. „Вплив радіаційного фактора Чорнобильської зони відчудження на організм тварин”. – 2006. Київ, Атіка. – С.163-173. 

Theses

  1. Kruglova O.B., Ermak E.L., Bolbukh T.V. binding modes of ethidium bromide to calf thymus DNA // Proceedings of the Workshop on the Structure and Function of Biomolecules II May 11-13, 2006. Bedlewo (Poland) – 2006 – P. 68.
  2. Gladkovskaya N.A. Multimodal binding of actinocin derivative to single stranded poly(dA)// Proceedings of the Workshop on the Structure and Function of Biomolecules II May 11-13, 2006. Bedlewo (Poland) – 2006 – P. 64.
  3. Boryskina O.P., Bolbukh T.V., Semenov M.A. Factors of stabilization of collagen structures: Quantitative estimations of energies of peptide-peptide and peptide –water hydrogen bonds// Proceedings of the Workshop on the Structure and Function of Biomolecules II May 11-13, 2006. Bedlewo (Poland) – 2006 – P. 54.
  4. Minakova Ye.O., Kruglova O.B. Influence of the structure of actinicin derivatives on binding process with Calf Thymus DNA// Proceedings of the Workshop on the Structure and Function of Biomolecules II 2006. Bedlewo (Poland) – May 11-13, 2006 – P. 68.
  5. Boryskina O.P., Semenov M.A. Peptide-peptide and peptide-water hydrogen bonds in collagen: estimation of energies on the basis of IR spectroscopy, quartz piezogravimetry and differential scanning calorimetry // Proceedings of the III-th International Conference on Hydrogen Bonding and Molecular Interactions. – Kyiv (Ukraine). – May 15-21, 2006. – P. 34.
  6. Борискина Е.П. Расчет тонкой структуры полосы Амид I в Раман спектрах poly(Gly-Pro-Pro) и коллагена // Сборник тезисов докладов II-й Всеукраинской научно-технической конференции студентов, аспирантов и молодых ученых «Актуальные вопросы теоретической и прикладной физики и биофизики» Физика. Биофизика. – Севастополь (Украина). –  17-22 апреля 2006 г. – С. 87-89.
  7. Ермак Е.Л., Круглова Е.Б. Особенности взаимодействия бромистого этидия с тимусной ДНК // актуальные вопросы теоретической и прикладной физики и биофизики “Физика. Биофизика – 2006”. Севастополь, 2006 г., С. 104.
  8. Близнюк Ю.Н., Круглова Е.Б. Раман исследование В→А структурного перехода ДНК в присутствии єтидиума бромида // Шоста Харківська конференція молодих науковців. Радіофізика та електроніка. – Харків, Україна. –13-14 грудня 2006. – С.33.
  9. Ермак Е.Л., Круглова Е.Б., Пальчиковская Л.Г., Алексеева И.В. Исследование конкурентного связывания аналогов цитидина и бромистого этидия с тимусной ДНК // Шоста Харківська конференція молодих науковців. Радіофізика та електроніка. – Харків, Україна. – 2006. – 13-14 грудня 2006. – С.37.
  10. Духопельников Е.В., Хребтова А.С. Моделирование конформационніх переходов Poly(rC), индуцированных изменением рН // Шоста Харківська конференція молодих науковців. Радіофізика та електроніка. – Харків, Україна. –13-14 грудня 2006. – С.36.
  11. Минакова Е.А., Круглова Е.Б. Моделирование влияния ионных сил на изотермы связывания лекарственных веществ с ДНК при разных значениях фактора кооперативности // Шоста Харківська конференція молодих науковців. Радіофізика та електроніка. – Харків, Україна. – 13-14 грудня 2006. –С.41.
  12. Мирошниченко Е.В., Шестопалова А.В. Молекулярно-динамическое моделирование различных спиральных форм полирибоцитидиловой кислоты // Шоста Харківська конференція молодих науковців. Радіофізика та електроніка. – Харків, Україна.– 13-14 грудня 2006. – С.41.
  13. Нестеренко А.Л., Мирошниченко Е.В., Шестопалова А.В. Компьютерное моделирование комплекса односпиральной полирибоцитидиловоц кислоты с кофеином методом докинга и молекулярной динамики // Шоста Харківська конференція молодих науковців. Радіофізика та електроніка. – Харків, Україна. –13-14 грудня 2006. – С.42.
  14. Хорунжая О.В., Кашпур В.А., Красницкая А.А. Гидратация кофеина и его интактного и гамма-облученного комплексов с ДНК по данным КВЧ-диэлектрометрии // Шоста Харківська конференція молодих науковців. Радіофізика та електроніка. – Харків, Україна. – 13-14 грудня 2006. – С.47.
  15. Борискина Е.П., Флори В. In vivo исследование эластичности тканей куриных эмбрионов на различных этапах эмбриогенеза // Шоста Харківська конференція молодих науковців. Радіофізика та електроніка. – Харків, Україна. –13-14 грудня 2006. – С.46.
  16. Малеєв В.Я. Деякі проблеми сучасної молекулярної біофізики // Тези доповідей IV з’їзду Українського біофізичного товариства, Донецьк, 19-21 грудня 2006, С.27.
  17. Борискина Е. П., Семенов М.А., Больбух Т.В., Суходуб Л.Б. особенности гидратации и конформационных переходов чистого и минерализованного коллагена // Тези доповідей IV з’їзду Українського біофізичного товариства, Донецьк, 19-21 грудня 2006, С.275.
  18. Кашпур В.А., Хорунжая О.В., Красницкая A.A. Изменения взаимодействия комплекса ДНК-кофеин с растоворителем при воздействии гамма излучения // Тези доповідей IV з’їзду Українського біофізичного товариства, Донецьк, 19-21 грудня 2006, С.300.
  19. Березняк Е.Г., Круглова Е.Б., Хребтова А.С., Духопельников Е.В., Зинченко А.В. Влияние производного актиноцина на конформационное состояние полирибоцитидиловой кислоты // Тези доповідей IV з’їзду Українського біофізичного товариства, Донецьк, 19-21 грудня 2006, С.273.
  20. Близнюк Ю.Н., Больбух Т.В. Структурные изменения ДНК при взаимодействии с ЭБ по данным Раман спектроскопии // Тези доповідей IV з’їзду Українського біофізичного товариства, Донецьк, 19-21 грудня 2006, С.274
  21. Глибицкий Г.М., Красницкая A. A., Гудзенко В.И. Текстуры пленок Na-ДНК, полученных из растворов при разных влажностях и температурах // Тези доповідей IV з’їзду Українського біофізичного товариства, Донецьк, 19-21 грудня 2006, С.286.
  22. Шестопалова А.В. О двух возможных механизмах влияния кофеина на биологическую активность производных актиноцина – аналогов противоопухолевых антибиотиков // Тези доповідей IV з’їзду Українського біофізичного товариства, Донецьк, 19-21 грудня 2006, С.332-333.

Synopsis

 Гладковська Н.О. Спектрофотометричний аналіз зв’язування біологічно активних лігандів з молекулами ДНК.– Автореферат дисертації на здобуття наукового ступеня канд. фіз.-мат. наук за спеціальністю 03.00.02 – біофізика. – Ротапринт ІРЕ ім. О.Я. Усикова НАН України, Харків, 2006. – 24 с.

2007 y.
 Articles

  1. Шестопалова А.В. Связывание производного актиноцина c фрагментами ДНК: моделирование методом Монте Карло // Биополимеры и клетка. – 2007. – Т.23. – С.35-44.
  2. Boryskina O.P., Bolbukh T.V., Semenov M.A., Gasan A.I., Maleev V.Ya. Energies of peptide-peptide and peptide-water hydrogen bonds in collagen: evidences from infrared spectroscopy, quartz piezogravimetry and differential scanning calorimetry // J. Mol. Struct. – 2007. – Vol. 827. – P. 1-10.
  3. Круглова Е. Б. Необычные формы изотерм адсорбции в трехкомпонентных системах // Биофизика. – 2007. – Т.52. – Вып. 5. – С. 822-824.
  4. Березняк Е.Г., Круглова Е.Б., Хребтова А.С., Духопельников Е.В., Зинченко А.В. Взаимодействие производного актиноцина с различными структурами poly(rC). // Биофизика. – 2007. – Т.52. – Вып. 5. – С. 812-821.
  5. Акимов В.И., Тулупенко В.Н., Шестопалова А.В., Alfinito E., Penneta C., Reggiani L. Электрические свойства молекулы белка в составе двухтерминального устройства / Вісник ХНУ. – Біофізичний вісник. – 2007. – Вып.1(18). – С.26-30.
  6. Борискина Е.П., Семенов М.А., Больбух Т.В., Суходуб Л.Б., Суходуб Л.Ф., Малеев В.Я. Влияние минерализации на гидратацию и структурное состояние коллагена // Вісник ХНУ. – Біофізичний вісник. – –Вип. 18. – С. 5-13.
  7. Гладковская Н.А Анализ Взаимодействия биологически активных лигандов с Нуклеиновыми кислотами // Біофізичний вісник – 2007. – Вып.19. – С. 55-64.
  8. Ермак Е.Л., Круглова Е.Б. Связывание теофиллина с тимусной дНК в присутствии конкурирующих лигандов // Біофізичний вісник. – 2007. – Вып.19. – С. 13-19.
  9. Ермак Е.Л., Круглова Е.Б., Пальчиковская Л.Г., Алексеева И.В. Спектрофотометрическое исследование механизмов связывания аналогов цитидина и бромистого этидия с днк // Биополимеры и клетка. – 2007. –T. 23. – вып.6. с.529-537.
  10. Березняк Е.Г., Круглова Е.Б., Хребтова А.С., Духопельников Е.В., Зинченко А.В. Влияние производного актиноцина Act III на плавление ДНК в составе комплексов ДНК – Aсt III при различных концентрациях лиганда. // Біофізичний вістник – 2007. – Вып.19. – С. 29-35.
  11. Еременко З.Е., Кашпур В.А. Диэлектрические измерения сильно поглощающих жидкостей в миллиметровом диапазоне длин волн // Вісник ХНУ. Біофізичний Вісник. – 2007. Вип. 19. – С. 122-136.
  12. Семенов М.А., Борискина Е.П., Малеев В.Я. Подвижность азотистых оснований при гидратации двунитевых полинуклеотидов в пленках. // Вісник ХНУ. – Біофізичний вісник, – 2007. – Вып.19. – С. 20-28.

Theses

  1. O. Minakova, O.B. Kruglova Investigation of ionic strength influence on the binding of the Actinomycin D deriveative to DNA//6th EBSA European Biophysics Congress, London (U.K.).-July 14th – 18th 2007. – P. S202.
  2. Boryskina O. P., Le Grand Y., Fleury V. Visualization of collagen distribution in skin by means of double imaging by two-photon excited fluorescence and second harmonic generation: implication for developmental biology. Proc. of the Mediterranean Microwave Symposium MMS 2007. May 14-16, 2007. Budapest, Hungary.
  3. Miroshnychenko K.V., Shestopalova A.V. Molecular dynamics simulation of DNA dodecamers of different sequence, Book of abstracts of the 2nd International Symposium “Methods and Applications of Computational Chemistry”, Kyiv, Ukraine, 2 – 4 July, 2007, p. 66.
  4. Golius A.M., Miroshnychenko K.V., Shestopalova A.V.Computer simulation of interaction of actinocin derivative with DNA fragments of different sequence, Book of abstracts of the 2nd International Symposium “Methods and Applications of Computational Chemistry”, Kyiv, Ukraine, 2 – 4 July, 2007, p. 65.
  5. Sukhanov O.S., Shestopalova A.V., Miroshnychenko K.V. “Analysis of intramolecular hydrogen bonds of actinocin derivatives – analogues of anticancer antibiotics”, Book of abstracts of the 2nd International Symposium “Methods and Applications of Computational Chemistry”, Kyiv, Ukraine, 2 – 4 July, 2007, p. 47.
  6. Kruglova O.B., Gladkovskaya N.A., Palchykovskaya L.N., Alexeeva I.V. Binding affinity of the 6-azacytidine to DNA molelules// XVIII International School-Seminar” Spectroscopy of Molecules and Crystals” 20.09-27.09.2007, Beregove, Crimea, Ukraine, p.215.
  7. Iermak Ie.L., Kruglova O.B. Method of spectrophotometrical investigation of competitive binding of two biologically active ligands with DNA // Тези Міжнародної конференції студентів і молодих науковців з теоретичної та експериментальної фізики „ЕВРИКА-2007”, м. Львів, Україна – 2007 – с. 25.
  8. Ермак Е.Л., Круглова Е.Б. Исследование связывания актиноцинового производного и бромистого этидия с тимусной ДНК// VII Харківська конференція молодих науковців “Радіофізика та електроніка”. 12-14.12.2007, Харків, Україна, с. 38.
  9. Минакова Е.А., Круглова Е.Б. Влияние одновалентных ионов на связывание актиноцинового производного с нативной и денатурированной ДНК// VII Харківська конференція молодих науковців “Радіофізика та електроніка”. 12-14.12.2007 , Харків, Україна, с. 37.
  10. Хребтова А.С., Духопельников Е.В., Березняк Е.Г. Определение параметров связывания лигандов с ДНК по данным дифференциальной сканирующей калориметрии. // VII Харківська конференція молодих науковців “Радіофізика та електроніка”, Харків, 2007. С.30.
  11. Zhivotova E.N., Zinchenko A.V., Kuleshova L.G., Dukhopelnykov E.V. Physical states of a binary system water – oxyethylated glycerol (polymerization degree is n = 5) at temperatures lower than 273 K. // Конференція молодих вчених «Фізика низьких температур», Харків 2007. С.21.
  12. Мирошниченко Е.В., Шестопалова А.В. “Динамика додекамеров ДНК различной последовательности”, Збірник анотацій VII Харківської конференції молодих науковців “Радіофізика та електроніка”, Харків, Україна, 12-14 грудня, 2007, с.34.
  13. Голиус А.М., Мирошниченко Е.В., Шестопалова А.В. “Молекулярный докинг производного актиноцина и фрагментов ДНК разной последовательности”, Збірник анотацій VII Харківської конференції молодих науковців “Радіофізика та електроніка”, Харків, Україна, 12-14 грудня, 2007, с.35.
  14. Филипский А.В. Исследование механизма термического разрушения нуклеиновых кислот. // VII Харківська конференція молодих науковців “Радіофізика та електроніка”, Харків, 2007. С.29.

Synopsis

  1. Борискіна О.П. Енергії водневих зв’язків, що стабілізують конформацію гідратованих колагенових структур. – Автореферат дисертації на здобуття наукового ступеня канд. фіз.-мат. наук за спеціальністю 03.00.02 – біофізика. – Ротапринт ІРЕ ім. О.Я. Усикова НАН України, Харків, 2007. – 19 с.
  2. Шестопалова Г.В. Молекулярні механізми гідратації та комплексоутоврення нуклеїнових кислот з біологічно активними речовинами // Автореферат дисертації на здобуття наук.ступ. доктора фіз.-мат. наук за спеціальністю 03.00.02 – біофізика. – Ротапринт ІРЕ ім. О.Я. Усикова НАН України, Харьків, 2007, 35 с.
2008 y.
Articles

  1. Sukhanov O.S., Shishkin O.V., Gorb L.,  Leszczynski J.,  Structure and hydrogen bonding in polyhydrated complexes of guanine. Structural Chemistry 2008, Vol 19, N 1 , 171-180.
  2. P. Boryskina, Y. Le Grand, C. Odin and V. Fleury. The role of distribution and orientation of collagen fibers in tissue development: study by means of double imaging by two-photon excited fluorescence and second harmonic generation microscopy. J. .European Microwave Association. – 2008. – V. 4. – N 3. – P. 255-259.
  3. Odin C, Guilbert T, Alkilani A, Boryskina OP, Fleury V, Le Grand Y. Collagen and myosin characterization by orientation field second harmonic microscopy. Opt Express. – 2008. – V.16. – N 20. – P.16151-6165.
  4. Al-Kilani A, Lorthois S, Nguyen TH, Le Noble F, Cornelissen A, Unbekandt M, Boryskina O, Leroy L, Fleury V. During vertebrate development, arteries exert a morphological control over the venous pattern through physical factors. Phys Rev E Stat Nonlin Soft Matter Phys. – 2008. – V.77. – (5 Pt 1):051912.
  5. N. Zhivotova, A.V. Zinchenko, L.G. Kuleshova, E.V. Dukhopelnikov, V.V. Chekanova Low-temperature phase behaviour of the binary system water–oxyethylated glycerol of polymerization degree n=5 and intermolecular interactions in the system // Molecular Physics. – 2008. – V. 106. – N. 14. – Р. 1751–1759
  6. Акимов В.И., Шестопалова А.В., Тулупенко В.Н., Alfinito E., Penneta C., Reggiani L. Способы моделирования флюктуаций молекулы белка в рамках метода нерегулярной сети импедансов // УФЖ, T. 53, N 6, C.595-601, 2008.
  7. Кашпур В.А., Малеев В.Я., Хорунжая О.В. Применение метода дифференциальной КВЧ диэлектрометрии в молекулярной биофизике // Радіофізика та електроніка. – Харків: Ін-т радіофізики та електрон. НАН України. – 2008. – Том 13, спец. вип. – С.446-454.
  8. Е.Н. Животова, Е.В. Духопельников Оценка количества воды, связанной с оксиэтилированными производными глицерина // Доп. НАН України. — 2008. — N — С. 89-93.
  9. Мирошниченко Е.В., Шестопалова А.В. Молекулярно-динамическое моделирование различных спиральных форм полирибоцитидиловой кислоты // Вісник ХНУ. – Біофізичний вісник, – 2008 – Вып.21 (2). – С. 5-18.
  10. Гладковская Н.А., Ермак Е.Л., Круглова Е.Б., Пальчиковская Л.И., Алексеева И.В. Взаимодействие 6-азацитидина с молекулами ДНК. // Вісник ХНУ. – Біофізичний вісник, – 2008. – Вып.21 (2). – С. 19-28.
  11. Glibitsky G.M. Na-DNA films with ions of metals. // Biophysical Bulletin. – 2008. – Issue 21 (2). – P.29-34.

Theses

  1. Березняк Е.Г., Духопельников Е.В., Хребтова А.С. Исследование плавления комплексов ДНК с профлавином при различных соотношениях концентраций ДНК – лиганд // Материалы IV Всеукраинской научно-технической конференции. Актуальные вопросы теоретической и прикладной биофизики, физики и химии «БФФХ-2008», Севастополь 2008. Тези доповідей. С.195-196.
  2. S. Khrebtova, Ye.V. Dukhopelnykov, E.G. Bereznyak, N.A.Gladkovskaya, A.V.Zinchenko. Thermodynamic parameters of DNA – proflavine interaction // 4th International Conference Physics of Liquid Matter: Modern Problems. Kyiv, Ukraine 2008. – Book of Abstr. – P.207.
  3. S. Khrebtova, Ye.V. Dukhopelnykov, E.G. Bereznyak, N.A. Gladkovskaya. Proflavine-DNA interaction at different ligand concentration // Збірник тез. Міжнародна наукова конференція присвячена 70-річчю від дня народження проф. Гойди О.А. Біофізичні механізми функціонування живих систем. Львів 2008. С.20-21.
  4. А.С. Хребтова. Спектроскопические исследования взаимодействия профлавина с матрицами различного нуклеотидного состава // Тези доповідей. VIII Харківська конференція молодих науковців “Радіофізика та електроніка”, Харків 2008. С.
  5. Ермак Е.Л., Круглова Е.Б. Сравнительный анализ взаимодействия взаимодействия теофиллина и кофеина с тимусной ДНК в присутствии конкурирующих лигандов // IV Всеукраинская научно-техническая конференция актуальные вопросы теоретической и прикладной биофизики, физики и химии “БФФХ – 2008”. Севастополь, Украина. – 2008. – Тезисы докладов. С.152 – 153.
  6. Ермак Е.Л., Круглова Е.Б. Методика анализа конкурентного связывания двух лигандов с нуклеиновыми кислотами // 1-а Всеукраїнська наукова конференція молодих вчених Фізика низьких температур КМВ-ФНТ-2008. – Харків, Україна. – 2008. – Тези доповідей. – С.102.
  7. Iermak Ie.L., Kruglova O.B. Study of ethidium bromide binding to calf thymus DNA in presence of competing ligands in aqueous solution // 4th International Conference Physics of Liquid Matter: Modern Problems PLM MP. – Kyiv, Ukraine. – 2008. – Book of Abstr. – P.206.
  8. V.Miroshnychenko, A.V.Shestopalova The Effect of Drug-DNA Interactions on the Intercalation Site Formation // Advanced Research Workshop “Molecular Self-Organization in Micro-, Nano-, and Macro-Dimensions: From Molecules to Water, to Nanoparticles, DNA and Proteins”, 8 – 12 June, Kiev, Ukraine, Book of Abstr. – Р.72
  9. Е.В. Мирошниченко Представление оси двойной спирали ДНК в виде ломанной с минимальнім числом отрезков // Тези доповідей. VIII Харківська конференція молодих науковців “Радіофізика та електроніка”, Харків 2008. – С.151
  10. Bliznyuk Ju.N., Bolbukh T.V., Gasan A.I. The molecular mechanisms of binding of riboflavin to DNA by the data of Raman spectroscopy and VIS-UV spectrophotometry. IV International Conference “Physics of Liquid Matter: Modern Problems”. – Kyiv, Ukraine. – 2008. – Book of Abstr. – P. 206.
  11. Bliznyuk J.N., Bolbukh T.V., Gasan A.I. Binding of riboflavin-5’-phosphate to DNA studied by the Raman spectroscopy and VIS-UV spectrophotometry. The Europolymer Conference 2008 (EUPOC 2008) on “Advanced Polymeric Materials for the Energy Resources Exploitation: Synthesis, Properties and Applications”, Italy, Gargnano (Brescia), 2008. – Book of Abstr. – P.78
  12. Kashpur V.A., Khorunzha O.V and Maleev V. Ya. Interrelation of hydration in solutions with complexation of biological molecules as revealed by dielectrometry. 4th International Conference Physics of Liquid Matter: Modern Problems PLM MP. – Kyiv, Ukraine. – 2008. – Book of Abstr. – P. 205.
  13. Кашпур В.А., Хорунжа О.В., Малєєв В.Я. Гідратаційні ефекти при утворенні комплексів біологічних молекул // Збірник тез. Міжнародна наукова конференція присвячена 70-річчю від дня народження проф. Гойди О.А. Біофізичні механізми функціонування живих систем. Львів 2008. С.16-17
  14. Шестопалова А.В. Молекулярные модели комплексов нуклеиновых кислот и биологически активных веществ в условиях мультимодального и конкурентного связывания // Актуальные вопросы теоретической и прикладной биофизики, физики и химии «БФФХ-2008», Севастополь 2008. Тези доповідей. С.193
  15. Yu. Tkachenko, А.V. Shestopalova, М.Y. Tolstorukov. ProtNA-ASA: Protein-Nucleic Acid Structural Database with Information of Accessible Surface Area NATO. Advanced Research Workshop “Molecular Self-Organization in Micro-, Nano-, and Macro-Dimensions: From Molecules to Water, to Nanoparticles, DNA and Proteins”, 8 – 12 June, Kiev, Ukraine, Book of Abstr. – Р.195
  16. М.Ю. Ткаченко, Е.П. Борискина, М.Е. Толсторуков, А.В. Шестопалова Исследование непрямых механизмов белково-нуклеинового узнавания с использованием базы данных ProtNA-ASA // Тези доповідей. VIII Харківська конференція молодих науковців “Радіофізика та електроніка”, Харків 2008. – С. 154
  17. В.И. Акимов, А.В. Шестопалова, В.Н. Тулупенко, L.Reggiani Моделирование действия одномолекулярного белкового нанобиосенсора // 3-я міжнародна науково-технічна конференція “Сенсорна електроніка та мікросистемні технології” (СЕМСТ-3), Україна, Одеса, Червень 2-7, 2008,  тези доповідей, с.214.
  18. Минакова Е.А., Круглова Е.Б. Связывание актиноцинового производного с ДНК в присутствии одновалентных ионов//IV Всеукраинская научно техническая конференция «Акутальные вопросы теоретической и прикладной биофизики, физики и химии «БФФХ-2008», 21-26.04.2008, Севастополь, Украина, С.197
  19. Minakova E.A., Kruglova E.B. Different interaction models for explanation of ligands binding to polynucleotides optical properties//XXIX European Congress on molecular spectroscopy “EUCMOS 2008”, 31.08-05.09.2008, Opatija, Croatia, Р. 196
  20. Minakova Ye., Kruglova O. Influence of different types of monovalent ions on binding parameters actinocine ligands to denatured DNA // Міжнародна наукова конференція „Біофізичні механізми функціонування живих систем”, 16-18.10.2008, Львів, Україна
  21. Минакова Е.А., Круглова Е.Б. Исследование влияния ионов щелочных металлов на комплексообразование в системах ДНК-лиганд // Тези доповідей. VIII Харківська конференція молодих науковців “Радіофізика та електроніка”, Харків 2008. С.153
  22. Борискина Е.П., Семенов М.А. Подвижность азотистых оснований при дегидратации ДНК в пленках // Тези доповідей. VIII Харківська конференція молодих науковців “Радіофізика та електроніка”, Харків 2008. С.168

Synopsis

  1. Єрмак Є. Л. “Конкурентне зв’язування біологічно активних речовин з полінуклеотидними матрицями”– Автореферат дисертації на здобуття наукового ступеня канд. фіз.-мат. наук за спеціальністю 03.00.02 – біофізика. – Ротапринт ІРЕ ім. О.Я. Усикова НАН України, Харків, 2008. – 19 с.
  2. Суханов О. С “Теоретичне дослідження структури та властивостей моно- і полігідратів гуаніну та аденіну”– Автореферат дисертації на здобуття наукового ступеня канд. хімічних наук за спеціальністю 02.00.04 – фізична хімія – Комп¢ютерно-копіювальний центр „МіФ”, Харків, 2008. – 19 с.
2009 y.
Articles

  1. Статьи Tkachenko M. Y., Boryskina O. P., Shestopalova A. V., Tolstorukov M. Y. ProtNA-ASA: Protein-nucleic acid structural database with information on accessible surface area // 10.1002/qua.22067 Published Online: 19 May 2009
  2. Miroshnychenko K.V., Shestopalova A. V. The Effect of Drug-DNA Interactions on the Intercalation Site Formation // Int.J.Qunt.Chem. DOI1002/qua.22290 Published Online: 27 Oct 2009
  3. Bliznyuk Yu.N., Kruglova E.B., Bolbukh T.V., Ovchinnikov D.V. Influence of solution acidity on structure of actinocin derivatives and their affinity to DNA studies as a function of pH by Raman spectroscopy // Spectroscopy Letters, v.42, 2009, P.498-505
  4. Близнюк Ю.Н., Больбух Т.В., Круглова Е.Б., Семенов М.А., Малеев В.Я. Исследование комплексообразования бромистого этидия с ДНК методом спектроскопии комбинационного рассеяния света // Биополимеры и клетка, т.25, № 2, 2009, с.126-132.
  5. Березняк Е.Г., Гладковская Н.А., Хребтова А.С., Духопельников Е.В., Зинченко А.В. Особенности взаимодействия профлавина с ДНК при различных соотношениях их концентраций // Биофизика, т.54, вып.5, 2009, с.805-812
  6. Жукова Т.В., Перский Е.Э., Больбух Т.В., Семенов М.А. Влияние деформации кожи на гидроксилирование пролина в синтезируемом коллагене типа I и его гидратацию // Доповіді Національної академії наук України, 2009, №5, с.191-194.
  7. Н. В. Древаль, С. Ю. Рубан, В. Г. Колесников. Влияние миллиметровых волн и лазерного излучения на структурно-динамические свойства воды в биологических системах // Науково-технічний бюлетень, вип. 10, № 1-2, 2009 г., стр. 427 – 413.
  8. Хорунжая О.В., Кашпур В.А., Малеев В.Я. Гидратация комплексов ДНК с полиаминами // Бiофiзичний вiсник. – 2009. – Вип. 22 (1). – C. 5-13.
  9. Филипский А.В. Механизм термического разрушения нуклеиновых кислот // Бiофiзичний вiсник. – 2009. – Вип. 22 (1). – C. 98-102.
  10. Минакова Е.А., Круглова Е.Б. Взаимодействие производного актиноцина с молекулами ДНК при разных концентрациях одновалентных ионов щелочных металлов Na+ и K+// Біофізичний Вісник, Вип 2 (23), 2009, c. 30-39.
  11. Колесников В. Г., Древаль Н. В., Каменев Ю. Е., Корж В. Г. Связь солнечной активности с электромагнитным откликом микроводорослей открытых водоёмов Харьковской области // Физика живого, Т. 17, No1, 2009. С.98-104.
  12. Древаль Н.В., Рубан С.Ю., Чернєцов О. А., Колесніков В. Г. Можливість застосування методу НВЧ-діелектрометрії для оцінки якості свіжоодержаного еякуляту бугаїв-плідників // Науково-технічний бюлетень.- №100. -2009.- С. 219-223.

Theses

  1. Boryskina O.P., Tkachenko M.Y., Shestopalova A.V., Tolstorukov M.Y. DNA accessible surface area and indirect protein-DNA recognition: study by bioinformatical approach // 7th EBSA European Biophysical Congress, July 11-15, Genova, Italy. – P.562
  2. Minakova E.A., Kruglova E.B. Different interaction models for explanation of ligands binding to polynucleotides optical properties//Xth international conference on molecular spectroscopy “From molecules to molecular materials and biological systems”, 6-10.09.2009, Kraków – Bialka Tatrzanska, Poland, p.87
  3. Ткаченко М.Ю., Борискина Е.П., Шестопалова А.В., Толсторуков М.Е. Исследование роли альтернативных конформаций торсионного угла гамма сахарофосфатного остова ДНК в белково-нуклеиновом узнавании // Актуальные вопросы теоретической и прикладной биофизики, физики и химии «БФФХ-2008», Севастополь 2009. Тези доповідей. С.141-143
  4. Минакова Е.А., Круглова Е.Б. Исследование влияния ионов щелочных металлов на параметры комплексообразования в системах лиганд – ДНК // V Всеукраинская научно техническая конференция «Акутальные вопросы теоретической и прикладной биофизики, физики и химии «БФФХ-2009», 21-25.04.2009, Севастополь, Украина, с.148
  5. Ткаченко М.Ю., Борискина Е.П., Шестопалова А.В., Толсторуков М.Е. Доступная поверхность ДНК при различных конформациях сахарофосфатного остова: значение для непрямого белково-нуклеинового узнавания // 2-а Всеукраїнська наукова конференція молодих вчених Фізика низьких температур КМВ-ФНТ-2009. – Харків, Україна. – 2009. – Тези доповідей. – С.91
  6. Пащенко В.В., Ермак Е.Л. Взаимодействие акридинового мутагена ICR-191 с тимусной ДНК // Конференція молодих вчених «Фізика низьких температур», 1-5 червня 2009, Харків. С. 90.
  7. Песина Д.А., Хорунжая О.В., Диэлектрические свойства и гидратация комплекса ДНК-профлавин // Програма і тезі доповідей 2-а Всеукраїнська наукова конференція молодих вчених «Фізика низьких температур КМВ-ФНТ-2009» 1-5 червня 2009 р., Харків, с. 96.
  8. Ткаченко М.Ю., Борискина Е.П., Шестопалова А.В., Толсторуков М.Е. Роль изменения торсионного угла гамма сахаро-фосфатного остова ДНК в механизмах непрямого узнавания // ХІІІ международная школа-конференция „Биология – наука ХХІ века”, 09 – 2.10.2009 г., Пущино, Россия, тезисы докладов, с.45-46
  9. Песина Д.А., Хорунжая О.В., Кашпур В.А. Применение метода КВЧ диэлектрометрии для определения степени гидратации комплекса ДНК с профлавином // ХІІІ международная школа-конференция „Биология – наука ХХІ века”, 09 – 2.10.2009 г., Пущино, Россия, тезисы докладов, с.146-147
  10. Колесников В. Г., Древаль Н. В., Каменев Ю. Е., Корж В. Г. Влияние некоторых участков электромагнитного спектра на реакцию водорослей открытых водоёмов Харьковской области // 8-я Международная конференция “Космос и биосфера”, 28 сентября – 3 октября 2009, Крым, г. Судак, стр. 141.
  11. Близнюк Ю.Н. Гидратация и структурное состояние комплекса ДНК-витамин В2 во влажных пленках // Збірник анотацій ІХ Харківська конференція молодих науковців «Радіофізика, електроніка, фотоніка та біофізика» 1-3 грудня 2009 р., с. 136.
  12. Ткаченко М.Ю., Борискина Е.П., Шестопалова А.В., Толсторуков М.Е. Конформационные переходы пары углов альфа-гамма сахарофосфатного остова ДНК в нуклеосомах // Збірник анотацій ІХ Харківська конференція молодих науковців «Радіофізика, електроніка, фотоніка та біофізика» 1-3 грудня 2009 р., с.127
  13. Песина Д.А., Хорунжая О.В., Кашпур В.А. Диэлектрические свойства и гидратация комплекса ДНК с бромистым этидием // Збірник анотацій ІХ Харківська конференція молодих науковців «Радіофізика, електроніка, фотоніка та біофізика» 1-3 грудня 2009 р., с. 126.
  14. Хребтова А.С., Духопельников Е.В., Березняк Е.Г. Расчет параметров связывания профлавина с ДНК по данным дифференциальной сканирующей калориметрии // Збірник анотацій ІХ Харківська конференція молодих науковців «Радіофізика, електроніка, фотоніка та біофізика» 1-3 грудня 2009 р., с.128
  15. Минакова Е.А. Определение вклада конкуренции ионов за места свзяывания в свободную энергию комплексообразования актиноцинового производного с ДНК // Збірник анотацій ІХ Харківська конференція молодих науковців «Радіофізика, електроніка, фотоніка та біофізика» 1-3 грудня 2009 р., с.125
  16. Песина Д.А., Хорунжая О.В., Кашпур В.А. Изменение гидратации ДНК при образовании комплекса с бромистым этидием по данным КВЧ диэлектрометрии // Конференція молодих вчених “Сучасні проблеми теоретичної фізики”, 24-26 грудня 2009 р., Київ, с. 30.

Synopsis
Древаль Н.В. “Застосування міліметрових і субміліметрових радіохвиль та їх комбінації в дослідженні біологічних об’єктів.” – Автореферат дисертації на здобуття наукового ступеня канд. Біол. наук за спеціальністю 03.00.02 – біофізика. – Ротапринт ІРЕ ім. О.Я. Усикова НАН України, Харків, 2009. – 23 с.

2010 y.
 Articles

  1. Tkachenko M. Y., Boryskina O. P., Shestopalova A. V., Tolstorukov M. Y. ProtNA-ASA: Protein-nucleic acid structural database with information on accessible surface area // Int.J.Qunt.Chem., v.110, 2010, p.230-232.
  2. Miroshnychenko K.V., Shestopalova A. V. The Effect of Drug-DNA Interactions on the Intercalation Site Formation // Int.J.Qunt.Chem., v.110, 2010, p.161-176.
  3. Fleury V., Al-Kilan A., Boryskina O.P. Cornelissen A. G. M., Nguyen T.- H., Unbekandt M., Leroyx L., Baffet G. Le Noble F., Sire O., Lahaye E. Introducing the scanning air puff tonometer for biological studies. – Phys Rev E 81(2 Pt 1):021920 (2010)
  4. Борискина Е.П., Ткаченко М.Ю., Шестопалова А.В. Полиморфизм ДНК и белково-нуклеиновое узнавание // Биополимеры и клетка. – 201 – № 5, Т.26. – С.360-372.
  5. Кашпур В.А., Хорунжая О.В., Малеев В.Я. Изменение гидратации при образовании комплексов ДНК-лиганд по данным диэлектрометрии // ДАНУ, т.7, 2010, с.170-175.
  6. Хорунжая О.В., Кашпур В.А., Песина Д.А., Малеев В.Я. Изменение гидратации при образовании комплексов ДНК с некоторыми интеркаляторами // Біофізичний Вісник, Вип. 1 (24), 2010, c.5-13.
  7. Березняк Е.Г., Гладковская Н.А., Духопельников Е.В., Хребтова А.С., Зинченко А.В. Спектроскопическое и калориметрическое исследование системы флавин-мононуклеотид – ДНК // Біофізичний Вісник, Вип. 1 (24), 2010, c.14-19.
  8. Кондакова Г. К., Семко Г.О., Древаль Н.В., Колесніков В.Г., Каменєв Ю.Ю. Комбінований вплив терагерцевого та міліметрового випромінювання на антиоксидантний статус та осмотичний гемоліз еритроцитів in vitro // Дерматология и венерология.- 2010.- №4 (50).- С. 33-37.
  9. Колесников В. Г., Древаль Н. В. Применение комбинированного воздействия электромагнитных и акустических волн на микроводоросли для выявления резонансных частот // Физика живого.- – Т. 18, No1.- С. 42 – 45.
  10. Березняк Е.Г., Гладковская Н.А., Хребтова А.С., Духопельников Е.В.,Зинченко А.В. Калориметрическое и спектрофотометрическое исследование связывания профлавина с ДНК из salmon testes // “Біофізичний вісник”. 2010. Вып. 2 (25) , c.26-33.
  11. Kashpur V.A., Maleev V.Ya., Khorunzhaya O.V. Application of differential EHF dielectrometry in molecular biophysics // Telecommunications and Radio Engineering. – 2010. – V.69. – n.16. – P. 1473-1489.

Theses

  1. Shestopalova A.V. Physical parameters as a criterion for estimation of efficacy of DNA-anticancer antibiotics complexation on the molecular level // 2nd International Conference on Drug Discovery and Therapy Dubai, United Arab Emirates, February 1 – 4, 2010, Р.
  2. Tkachenko M.Y., Boryskina O.P., Shestopalova A.V., Tolstorukov M.Y. Gamma angle transitions in nucleosomal DNA backbone: significance for protein–DNA recognition // New Biotechnology. – 2010.V. 27(Supplement 1). – Abstracts of the 4th ESF Conference on Functional Genomics & Disease, 14–17 April 2010, Dresden, Germany – P. S24 (www.elsevier.com/locate/nbt)
  3. Iermak Ie.L., Pashchenko V.V. Acridine mutagen ICR-191 binding to calf thymus dna in presence of methylxanthines // Proceedings of the International Conference “5th International Conference Physics of Liquid Matter: Modern Problems PLM MP”. – Kyiv (Ukraine). – 2010. – Р. 257.
  4. Kashpur V.A., Khorunzhaya O.V., Pesina D.A. Hydration changes in DNA – ligand complexes // Proceedings of the International Conference “5th International Conference Physics of Liquid Matter: Modern Problems PLM MP”. – Kyiv (Ukraine). – 2010. – Р. 281.
  5. Dukhopelnikov E.V., Bereznyak E.G., Khrebtova A.S., Gladkovskaya N.A. Сalculation of ligand to DNA binding parameters from the liquid calorimetry data // Proceedings of the International Conference “5th International Conference Physics of Liquid Matter: Modern Problems PLM MP”. – Kyiv (Ukraine). – 2010. – Р.284.
  6. Dukhopelnikov E.V., Bereznyak E.G., Khrebtova A.S., Gladkovskaya N.A., Zinchenko A.V. Study of proflavine to DNA binding by means of the liquid calorimetry method // Proceedings of the International Conference “5th International Conference Physics of Liquid Matter: Modern Problems PLM MP”. – Kyiv (Ukraine). – 2010. – Р.251.
  7. Minakova E.A., Blyzniuk Iu.N., Kruglova E.B., Bolbukh T.V. Spectroscopic and piezogravimetric investigation of alkaline ions influence on the complexation in the intercalated ligand-DNA system // Proceedings of the International Conference “5th International Conference Physics of Liquid Matter: Modern Problems PLM MP”. – Kyiv (Ukraine). – 2010. – Р. 280
  8. Kondakova A. Telichko T., Dreval N., Kolesnikov V., Korzh V. Effect of combined tera- and gigahertz irradiation on hemolytic features of human erythrocytes in vitro // MSMW’2010., International Kharkov Symposium on Physics and Engineering of Microwaves, Millimeter and Submillimeter Waves Kharkov, Ukraine, June 21 – 26, 2010, G
  9. Glibitskiy G.M., Maleev V.Ya., Izhyk E.V. Cell for measurement of dielectric permittivity of solution // MSMW’2010., International Kharkov Symposium on Physics and Engineering of Microwaves, Millimeter and Submillimeter Waves Kharkov, Ukraine, June 21 – 26, 2010, G
  10. Glibitskiy G.M. Energy of activation of saccharose in solution // MSMW’2010., International Kharkov Symposium on Physics and Engineering of Microwaves, Millimeter and Submillimeter Waves Kharkov, Ukraine, June 21 – 26, 2010, G
  11. Ермак Е.Л., Пащенко В.В. Взаимодействие акридинового мутагена ICR-191 с кофеином и теофиллином //  Збірник тез доповідей конференції молодих вчених: “VI Международная научно-техническая конференция актуальные вопросы теоретической и прикладной биофизики, физики и химии “БФФХ – 2010”. Севастополь, Украина, 26-30 апреля 2010 г. –  Т. 2. – С.134.
  12. Д. А. Песина, О. В. Хорунжая, В. А. Кашпур. Гидратация комплексов ДНК с ароматическими лигандами по данным метода КВЧ диэлектрометрии // Тезисы докладов VI Международной научно-технической конференции «Актуальные вопросы теоретической и прикладной биофизики, физики и химии», 26 – 30 апреля 2010 г., Севастополь, Украина. – 2010. – Т. 2. – С.138-139.
  13. Березняк Е.Г., Хребтова А.С., Духопельников Е.В., Гладковская Н.А. Зинченко А.В. Исследование взаимодействия флавинмононуклеотида с ДНК // VI Международная научно-техническая конференция «Актуальные вопросы теоретической и прикладной биофизики, физики и химии» БФФХ – 2010, Севастополь, 26-30 апреля 2010 г., с.161-164.
  14. Духопельников Е.В., Хребтова А.С., Березняк Е.Г., Гладковская Н.А., Зинченко А.В. Расчет параметров связывания лигандов с ДНК по данным дифференциальной сканирующей калориметрии // VI Международная научно-техническая конференция «Актуальные вопросы теоретической и прикладной биофизики, физики и химии» БФФХ – 2010, Севастополь, 26-30 апреля 2010 г., с.186-189.
  15. Ткаченко М.Ю., Борискина Е.П., Шестопалова А.В., Толосторуков М.Е. Положение и сиквенс-специфичность конформаций торсионных углов альфа и гамма сахарофосфатного остова ДНК в нуклеосоме // VI Международная научно-техническая конференция «Актуальные вопросы теоретической и прикладной биофизики, физики и химии» БФФХ – 2010, Севастополь, 26-30 апреля 2010 г., с.155-158.
  16. Минакова Е.А., Близнюк Ю.Н. Спектрофотометрическое и пьезогравиметрическое исследование влияния ионной силы на образование комплексов ДНК с лигандом актиноцинового типа // Збірник тез доповідей конференції молодих вчених: VI Международная научно-техническая конференция «Актуальные вопросы теоретической и прикладной биофизики, физики и химии» БФФХ – 2010, Севастополь, Украина, 26-30 апреля – С.160-161.
2011 y.
Articles

  1. Beshnova D.A., Bereznyak E.G., Shestopalova A.V., Evstigneev M.P. A novel computational approach “BP-STOCH” to study ligand binding to finite lattice // – 2011. – V.95. – N.3. – P.208-216.
  2. Fleury V., Boryskina O.P., Al-Kilani A. Hyperbolic symmetry breaking and its role in the establishment of the body plan of vertebrates / C. R. Biol. – 2011. – V.334.– N.7. – P. 505-515.
  3. Iermak Light-absorption spectroscopy of mutagen – DNA complex: binding model selection and binding parameters calculation / Iermak Ie. // J. Applied Electromagnetism. – 2011. – V.13, N 3. – P. 15-22.
  4. Гасан А.И., Малеев В.Я., Филипский А.В. Исследование термической устойчивости нуклеиновых кислот и их структурных компонентов // Биофизика. – 2011. – Т.56, № 3. – С.403-409
  5. Борискина Е.П., Ткаченко М.Ю., Шестопалова А.В. Комплексы белки-ДНК: специфичность и механизмы узнавания // Биополимеры и клетка. – 201 – № 1, Т.27. – С.3-16
  6. Древаль Н.В., Колесников В.Г., Кондакова А.К., Теличко Т.В. Исследование поверхностного натяжения плазмы крови больных дерматозами с помощью акусто-диэлектрического метода // Дерматология и венерология.- 2011.- № 4.- С. 47-51
  7. Глибицкий Г.М., Джелали В.В., Зегря Г.Г., Рошаль А.Д., Мартинов А.В. Исследование межфазных границ, содержащих адсорбированные наночастицы Ag@N и нанокластеры Ag@NДНКN // Вопросы химии и хим. технологии. – 2011. – №4. – С. 162-164.
  8. Близнюк Ю.Н., Семёнов М.А., Больбух Т.В., Шестопалова А.В., Малеев В.Я. Проявление межмолекулярных водородных связей в гетерокомплексах биологически активных веществ по данным колебательной спектроскопии / Біофізичний Вісник – 2011.  – Вып. 27(2). – C.5-16
  9. Глибицкий Г.М. Текстура пленок ДНК с ионами серебра // Вісник СумДУ. Серія «Медицина», №2, 2011. С.51-54
  10. Глибицкий Г.М., Семенов М.А. Текстуры пленок Na-DNA, полученные из растворов, содержащих Трис и ЭДТА // Біофізичний вісник. – 2011.  – Вып. 27(2). – С.26-29.

Theses

  1. Шестопалова А.В., Борискина Е.П., Ткаченко М.Ю., Толсторуков М.Е. Механизмы белково-нуклеинового узнавания и конформационная динамика ДНК // Сборник тезисов VII Международной научно-технической конференции «Актуальные вопросы теоретической и прикладной биофизики, физики и химии – БФФХ – 2011». Севастополь, Украина, 26-30 апреля 2011 г. – С.150-151.
  2. Песина Д. А., Хорунжая О. В., Кашпур В. А., Шестопалова А. В. Диэлектрические свойства и гидратация комплексов ДНК с некоторыми интеркаляторами // Сборник тезисов VII Международной научно-технической конференции «Актуальные вопросы теоретической и прикладной биофизики, физики и химии – БФФХ – 2011». Севастополь, Украина, 26-30 апреля 2011 г. – С.156-157.
  3. Ермак Е.Л. Спектрофотометрическое исследование конкурентного связывания кофеина и бромистого этидия с тимусной ДНК // Сборник тезисов VII Международной научно-технической конференции «Актуальные вопросы теоретической и прикладной биофизики, физики и химии – БФФХ – 2011». Севастополь, Украина, 26-30 апреля 2011 г. – С.177.
  4. Духопельников Е.В., Хребтова А.С., Березняк Е.Г., Гладковская Н.А. Теоретическое описание процесса плавления комплекса ДНК-лиганд // Сборник тезисов VII Международной научно-технической конференции «Актуальные вопросы теоретической и прикладной биофизики, физики и химии – БФФХ – 2011». Севастополь, Украина, 26-30 апреля 2011 г. – С.198-200.
  5. Духопельников Е.В., Хребтова А.С., Березняк Е.Г., Гладковская Н.А., Зинченко А.В. Влияние актиноциновых производных ActII и ActIII на термодинамические параметры плавления ДНК из молок лосося // Сборник тезисов VII Международной научно-технической конференции «Актуальные вопросы теоретической и прикладной биофизики, физики и химии – БФФХ – 2011». Севастополь, Украина, 26-30 апреля 2011 г. – С.200-202.
  6. Шестопалова А.В. Прогнозирование биологической активности противоопухолевых препаратов на молекулярном уровне // Сборник тезисов международной конференции «Биологически активные вещества: фундаментальные и прикладные вопросы получения и применения», 23-28 мая 2011, Новый Свет, АР Крым, Украина, с. 211-212.
  7. Борискіна О.П., Житникова М.Ю., Шестопалова Г.В. Роль альтернативних конформацій сахарофосфатного кістяку ДНК в нуклеїново-білковому впізнаванні // Сборник тезисов V съезда Украинского биофизического общества, Луцк, 22-25 июня 2011, с.27-28.
  8. Борискіна О.П., Житнікова М.Ю., Шестопалова Г.В. Конформаційна динаміка сахарофосфатного кістяка ДНК у складі нуклеосом // Сборник тезисов V съезда Украинского биофизического общества, Луцк, 22-25 июня 2011, с. 28.
  9. Глибицкий Г.М., Глибицкий Д.М. Застосування кювет різною робочою довжиною для дослідження властивостей поліетиленгліколю // Сборник тезисов V съезда Украинского биофизического общества, Луцк, 22-25 июня 2011, с. 38-39.
  10. Колесніков В.Г., Древаль Н.В. Ефективність впливу акустичних хвиль на діелектричні параметри мікроводоростей для розробки біосенсора дисбалансу аква-системи // Сборник тезисов V съезда Украинского биофизического общества, Луцк, 22-25 июня 2011, с. 70-71.
  11. Близнюк Ю.Н., Семенов М.А., Шестопалова А.В. Исследование гетероассоциации флавин мононуклеотида, бромистого этидия и теофиллина в водных растворах методами ик и Раман спектроскопии // Сборник тезисов V съезда Украинского биофизического общества, Луцк, 22-25 июня 2011, с.24-25.
  12. Shashel Ya.V., Shestopalova A.V., Tolstorukov M.Y. The influence of sugar switches dynamics on the formation of bending deformation of DNA on base pair level // Methods and Applications of Computational Chemistry, Forth International Symposium MACC-4 28 June – 2 July 2011, Lviv, Ukraine, Book of abstracts, P.135.
  13. Pesina D. A. Hydration effects in complexation of DNA with biologically active compounds / D. A. Pesina, O. V. Khorunzhaya, V. A. Kashpur, A. V. Shestopalova // 36th FEBS Congress “Biochemistry for tomorrow’s medicine”, June 25-30, 2011, Torino, Italy : book of abstracts. – The FEBS Journal. – 2011. – V. 278 (Supplement 1). – P. 440-441.
  14. Iermak Ie., Light-absorption spectroscopy of mutagen-DNA complex in presence of competing biologically active compounds / Iermak Ie., Piosik J., Woziwodzka A., Gwizdek-Wisniewska A. // XXX URSI General Assembly and Scientific Symposium of International Union of Radio Science, Istanbul, Turkey, P. 249.
  15. Golunski G., Woziwodska A., Iermak Ie., Piosik J. Formation of stacking aggregates between methylxantines and aromatic mutagens reduces their biological activity // 2nd Congress of Biochemistry and Cell Biology, September 5th-9th, 2011, Krakow, Poland, P. 74.
  16. Shestopalova A.V., Boryskina E.P., Zhitnikova M.Yu., Tolstorukov M.Ye. Nucleosome as an example of a nanosystem formation: structural dynamics of nucleosomal DNA // Nanobiophysics 2011: fundamental and applied aspects, Kiev, 6-9 october 2011, Kiev, Ukraine, p.118.
  17. Bereznyak E.G., Dukhopelnikov E.V., Khrebtova A.S., Gladkovskaya N.A. Theoretical approach for determination of ligand to DNA binding parameters from two-dimentional DSC curves // Nanobiophysics 2011: fundamental and applied aspects, Kiev, 6-9 october 2011, Kiev, Ukraine, p.51.
  18. Glibitski D.M., Glibitsky G.M. Fractal properties of DNA film textures // Nanobiophysics 2011: fundamental and applied aspects, Kiev, 6-9 october 2011, Kiev, Ukraine, p.50.
  19. Jelali V.V., Glibitsky G.M., Semenov M.A., Volyansky A.Yu. Films of DNA with nano-silver particles // Nanobiophysics 2011: fundamental and applied aspects, Kiev, 6-9 october 2011, Kiev, Ukraine, p.61.
  20. Dreval N.V., Kondakova A.K., Kolesnikov V.G., Semko G.A., Kamenev Yu.E. Effects of electromagnetic radiance of terahertz range on nanosystem b-adrenergic receptor/G-protein of erythrocytes membrane // Nanobiophysics 2011: fundamental and applied aspects, Kiev, 6-9 october 2011, Kiev, Ukraine, p.126.
  21. Древаль Н.В., Колесников В.Г. Регуляция геотермальных течений в Мировом океане путем управления жизнедеятельностью микроводорослей // IX Международная Крымская конференция “Космос и биосфера” – «Актуальные вопросы биофизики и экологии»: Алушта, Крым, Украина, 10 – 15 октября, 2011 г.
  22. Glibitskiy D. M. Evaluation of cell for measuring of dielectric properties in a wide temperature range as exemplified by polyethyleneglycol solution [Електроний ресурс] / D. M. Glibitskiy // 11th Kharkiv Young Scientists Conference on Radiophysics, Electronics, Photonics and Biophysics. – Kharkiv, 2011. – 1 електрон. опт. диск (CD-ROM). – Загл. з етикетки диску.
  23. Glibitskiy D. M. Investigation of relationship of fractal characteristics of DNA films with mutagenic effect of metal ions [Електроний ресурс] / D. M. Glibitskiy // 11th Kharkiv Young Scientists Conference on Radiophysics, Electronics, Photonics and Biophysics. – Kharkiv, 2011. – 1 електрон. опт. диск (CD-ROM). – Загл. з етикетки диску.
  24. Minakova Ye. A. Spectrophotometric investigation of proflavine and caffeine competitive binding to DNA [Электронный ресурс] / Ye. A. Minakova // 11th Kharkiv Young Scientists Conference on Radiophysics, Electronics, Photonics and Biophysics. – Kharkiv, 2011. – 1 електрон. опт. диск (CD-ROM). – Загл. з етикетки диску.
  25. Blyzniuk Iu. N. Intermolecular hydrogen bond in hetero-complexes of biologically active aromatic molecules by the methods of vibrational spectroscopy // 11th Kharkiv Young Scientists Conference on Radiophysics, Electronics, Photonics and Biophysics. – Kharkiv, 2011. – 1 електрон. опт. диск (CD-ROM). – Загл. з етикетки диску.
  26. Shashel Ya.V., Shestopalova A.V. The DNA deformability in the process of indirect protein-nuclein interaction // III International Young Scientists Conference “Modern Problems of Theoretical Physics”, December 21-23, 2011, Kyiv, Ukraine. Books of Abstracts, P.9.
2012 y.
Monograph

  1. Малєєв В. Я., Семенов М. О., Шестопалова Г. В. Фізичні принципи побудови системи біополімер–вода, с. 11-70: монография: Благой Ю. П., Веселков О. Н., Волков С. Н., Говорун Д. М., Євстигнєєв М. П., Жураківський Р. О., Корнелюк О. І., Малєєв В. Я., Семенов М. О., Сорокін В. О., Харкянен В. М., Христофоров Л. М., Шестопалова Г. В. (за ред. В. Я. Малєєва). Фізичні принципи молекулярної організації і структурної динаміки біополімерів. Монографія (ІРЕ ім. О.Я.Усикова НАНУ, ФТІНТ ім. Б.Є.Веркіна НАНУ, ІМБіГ НАНУ, ІТФ ім. М.М.Боголюбова, Інститут фізики НАНУ, СевНТУ МОН. Вид. ХНУ імені В. Н. Каразіна, Харків, 2012; 352 c. (ум. друк. арк. 15,54), УДК 577.3, ББК 28.07, Ф 50, Тираж 300, ISBN 978-966-623-906-1.

Articles

  1. Semenov M.A. Intermolecular hydrogen bonds in hetero-complexes of biologically active aromatic molecules probed by the methods of vibrational spectroscopy / M.A. Semenov, Iu.N. Blyzniuk, T.V. Bolbukh, A.V. Shestopalova, M.P. Evstigneev, V.Ya. Maleev // Spectrochimica Acta Part A: Molecular and Biomolecular Spectroscopy. – -V. 95. – p. 224–229.
  2. Glibitskiy G. M. Interaction of DNA with Silver Nanoparticles / G. M. Glibitskiy et al. // Ukr. Phys. J. – 2012. – 57, N 7, – P.695-699.
  3. Колесников В.Г., Хмель Н.В., Хмель С.И. Оценка биологического заражения смазочно-охлаждающей жидкости в миллиметровом диапазоне радиоволн // Физика живого.–– Т. 20, № 2.– С. 38 – 42.

Theses

  1. Близнюк Ю.Н. Образование межмолекулярных водородных связей в гетероассоциатах биологически активных веществ по данным колебательной спектроскопии. VIII Международная науч.-техн. конф. “Актуальные вопросы биологической физики и химии”, Севастополь, 2012, с. 128-129.
  2. Песина Д. А. Диэлектрические свойства и гидратация комплекса ДНК-хлорофиллин / Д. А. Песина, О. В. Хорунжая, В. А. Кашпур, А. В. Шестопалова // Матер. VIII Междунар. научн.-техн. конф. «Актуальные вопросы биологической физики и химии БФФХ-2012», 23-27 апреля 2012 г., Севастополь, Украина: тезисы докладов. – Севастополь: СевНТУ. – 2012. – С. 131-132.
  3. Березняк Е.Г., Гладковская Н.А., Духопельников Е.В., Мирошниченко Е.В., Песина Д.А., Хорунжая О.В., Хребтова А.С., Шестопалова А.В. Комплексный подход к исследованию взаимодействия лигандов с нуклеиновыми кислотами. (Сomplex approach to the investigation of ligands interaction with nucleic acids.)/ IV Съезд биофизиков России. Симпозиум I «Физико-химические основы функционирования биополимеров и клеток» Материалы докладов. – Нижний Новгород, 2012. – С. 44.
  4. Березняк Е.Г., Духопельников Е.В., Хребтова А.С., Шестопалова А.В. Моделирование кривых теплопоглощения комплексов днк-лиганд при мультимодальном и конкурентном связывании. (Modeling of heat absorption curves of DNA-ligand complexes at multimodal and competitive binding) / IV Съезд биофизиков России. Симпозиум I «Физико-химические основы функционирования биополимеров и клеток» Материалы докладов. – Нижний Новгород, 2012. – С. 45.
  5. Глибицкий Д.М., Семенов М.А., Гасан А.И., Рошаль А.Д. Влияние ионов серебра и кальция на формирование дендритной текстуры Nа-ДНК в пленках / IV Съезд биофизиков России. Симпозиум IV «Новые тенденции и методы в биофизике». Материалы докладов. – Нижний Новгород, 2012. – C. 370.
  6. Pesina D. A. Dielectric properties and hydration of DNA complexes with biologically active compounds / D. A. Pesina,  V. Khorunzhaya, V. A. Kashpur, A. V. Shestopalova // 7th Conference of the International Dielectric Society, September 3-7, 2012, Leipzig, Germany: book of abstracts. – P. 116.
  7. Zhitnikova M.Yu., Boryskina E.P., Shestopalova A.V. Transitions of the γ angle in the sugar-phosphate DNA backbone and indirect protein-DNA recognition // International Conference “Problems of Theoretical Physics”, October 8-11, 2012, Kyiv, Ukraine: book of abstract. – P.30.
  8. Khrebtova A.S. Calculation approaches for analysis of ligand to DNA binding parameters prom DSC experiment [Электронный ресурс] / A.S.Khrebtova // 12th Kharkiv Young Scientists Conference on Radiophysics, Electronics, Photonics and  – Kharkiv, 2012. – 1 электрон. опт. диск (CD-ROM). – Загл. с  этикетки диска.
  9. Glibitskiy G..M., Yu Shan, Golyuk E.O., Povelitsa A.A.  Change of conductivity of Lao Gong point after Tai Chi exercise // Психофізіологічні та вісцеральні функції в нормі і патології. VI Міжнародна наукова конференція. Україна, Київ, 9-11 жовтня 2012 року. Тези доповідей.
2013 y.
 Articles

  1. Dukhopelnikov E. V. Determination of ligand to DNA binding parameters from two-dimensional DSC curves / E. V. Dukhopelnikov, E. G. Bereznyak, A. S. Khrebtova, A. O. Lantushenko, A. V. Zinchenko // J. Therm. Anal. Calorim. (2013), V.111, N3, pp 1817–1827.
  2. Glibitskiy G. M. Texture formation in DNA films with alkali metal chlorides / G. M. Glibitskiy, Perepelytsya S.M., Volkov S.N. // Biopolymers (2013), V. 99, рр. 508-516.
  3. Ponomarenko A.M. Changes Of Hydration Level In Type I Collagen And Glycosaminoglycans Synthesized In The Rat’s Skin Under The Mechanical Stress / A.M. Ponomarenko, T.V. Kostina, I.M. Blyzniuk, E.E. Persky, M.A.Semenov // European Researcher (2013), V. 44, № 3-2, pр.666-672.
  4. Солошенко Э.Н. Оценка диэлектрической проницаемости эритроцитов при выявлении сенсибилизации к анестезирующему средству артифрину с помощью метода КВЧ-диэлектрометрии / Э.Н. Солошенко, А.К. Кондакова, В.Г. Колесников, Н.В. Хмель, З.М. Шевченко, Т.П. Ярмак. // Дерматология и венерология.– 2013.– № 3 (61).– С. 32 – 37.
  5. Glibitskiy G. Fractal textures of bovine serum albumin films / Bioph Bul. 2013. – N. 30(2). – P. 5-14.
  6. Pesina D. A., Kashpur V. A., Khorunzhaya O. V., Shestopalova A.  Hydration of complexes of chlorophyllin with human and bovine serum albumin investigated by differential EHF dielectrometry // Біофізичний Вісник (Вісник ХНУ) – Bioph Bul. 2013. – N. 30(2). – P. 5-14.

Theses

  1. Духопельников Е.В. Плавление систем ДНК-лиганд при мультимодальном и конкурентном связывании / Е.В. Духопельников, Е.Г. Березняк, А.С. Хребтова, Н.А. Гладковская // Труды XIV Международной конференции по термическому анализу и калориметрии в России (RТАС – 2013). С-Петербург, 2013. – С. 247-250.
  2. Pesina D. A. Dielectric properties and hydration of human and bovine serum albumin complexes with chlorophyllin / O. V. Khorunzhaya, V. A. Kashpur, A. V. Shestopalova // 9th EBSA European Biophysics Congress, July 13-17, 2013, Lisbon, Portugal : book of abstracts. – Eur. Biophys. J. – 2013. – V. 42 (Suppl. 1). – P. S180.
  3. Духопельников Е.В. Влияние флавинмононуклеотида на термодинамические параметры плавления комплексов бромистого этидия с ДНК. / Е.В. Духопельников, А.С. Хребтова, Е.Г. Березняк, Н.А. Гладковская, А.В. Фомин, А.В. Зинченко // Актуальні питання біологічної фізики та хімії. БФФХ – 2013. – Севастополь, 2013. – С.80.
  4. Песіна Д. О. Діелектричні властивості та гідратація комплексів хлорофіліну з біологічними полімерами / Д.О. Песіна, О.А. Каплун, Г.В. Шестопалова // ІІІ Всеукраїнська наукова конференція молодих вчених «Фізіологія: від молекул до організму», Київ, 24-25 жовтня 2013. – С.
  5. Gerus A.A. Тhe study of flavin mononucleotide-ethidium bromide-DNA system by calorimetry and spectrophotometry [Электронный ресурс] / A.A.Gerus, A.V. Fomin // 13th Kharkiv Young Scientists Conference on Radiophysics, Electronics, Photonics and Biophysics. – Kharkiv, 2013. – 1 электрон. опт. диск (CD-ROM). – Загл. с этикетки диска.
  6. Blyzniuk Iu. N. pH-dependent self-association of flavin-mononucleotide. [Электронный ресурс] / Iu. N. Blyzniuk // 13th Kharkiv Young Scientists Conference on Radiophysics, Electronics, Photonics and Biophysics. – Kharkiv, 2013. – 1 электрон. опт. диск (CD-ROM). – Загл. с этикетки диска.
  7. Pesina D. A. Dielectric study on hydration of HSA and BSA complexes with chlorophyllin [Электронный ресурс] / D. A. Pesina // 13th Kharkiv Young Scientists Conference on Radiophysics, Electronics, Photonics and Biophysics. – Kharkiv, 2013. – 1 электрон. опт. диск (CD-ROM). – Загл. с этикетки диска
  8. Глибицкий Д.М. Резонансные взаимодействия карбонильных колебаний в структуре самоассоциата флавинмононуклеотида [Электронный ресурс] / 13th Kharkiv Young Scientists Conference on Radiophysics, Electronics, Photonics and Biophysics. – Kharkiv, 2013. – 1 электрон. опт. диск (CD-ROM). – Загл. с этикетки диска.
  9. Blyzniuk Yu.N. Self-association and hydration of flavin mononucleotide in films / Yu.N. Blyzniuk, D.M. Glibitskiy // V Young Scientists Conference “Problems of Theoretical Physics”. – Kyiv, 2013. – Р. 72.
  10. Kondakova A.K. Investigation of terahertz radiations influence on enzyme α-amylase / A.K.Kondakova, N.V. Khmel, V.G. Kolesnikov, Yu.E. Kamenev, T.V. Telichko, V.G. Korzh. // The Eighth International Kharkov Symposium on Physics and Engineering of Microwaves, Millimeter and Submillimeter Waves (MSMW’2013) and Workshop on Terahertz Technologies (TERATECH’2013), Kharkov, Ukraine, June 23 – 28, G 17.
  11. Soloshenko E. Operation monitoring of allergic reaction to artifrin by means of EHF-dielectrometry method / E. Soloshenko, A. Kondakova, V. Kolesnikov, N. Khmel, Z. Shevchenko, T. Yarmak, V. Korzh. // The Eighth International Kharkov Symposium on Physics and Engineering of Microwaves, Millimeter and Submillimeter Waves (MSMW’2013) and Workshop on Terahertz Technologies (TERATECH’2013), Kharkov, Ukraine, June 23 – 28, 2013, G
  12. Shestopalova A. V. Monte Carlo simulation of hydration of DNA-binding biologically active compounds / A. V. Shestopalova, D. A. Pesina // Methods and Applications of Computational Chemistry, Fifth Symposium, 1 – 5 July 2013, Kharkiv, Ukraine, Book of Abstracts, p. 68
  13. Miroshnychenko K.V. The study of different binding modes of proflavine with DNA and RNA sequences by molecular docking method: evidence for a proflavine as a minor groove binder / K.V. Miroshnychenko, A.V. Shestopalova // Methods and Applications of Computational Chemistry, Fifth Symposiu m, 1 – 5 July 2013, Kharkiv, Ukraine, Book of Abstracts, p. 67
  14. Blyzniuk Iu.N. Intermolecular hydrogen bonds in hetero-complexes of biologically active aromatic ligands: Monte Carlo simulations / Iu.N. Blyzniuk, M.A. Semenov, A.V. Shestopalova // Methods and Applications of Computational Chemistry, Fifth Symposium, 1 – 5 July 2013, Kharkiv, Ukraine, Book of Abstracts, p. 107
  15. Glibitskiy D.M. Specifics of textures of films formed from DNA-metal ion solutions / D.M. Glibitskiy, G.M. Glibitskiy, M.A. Semenov, V.Y. Maleev, A.I. Gasan // Nanotechnology and nanomaterials. International research and practice conference (August 25 – September 1, 2013, Bukovel, Ukraine): book of abstracts. – Bukovel, 2013. – P. 395.
  16. V. Khmel, V.G. Kolesnikov, Y.E. Kamenev, V.G. Korzh. Investigation of reparational properties of lens proteins on the basis of combined influence of terahertz and millimeter radiance // International research and practice conference «Nanotechnology and nanomaterials», Bukovel, Ukraine, from August 25 to September 1, 2013, P. 57.
  17. Zhitnikova M.Yu. Some physical principles of nanosystems’ formation on the example of protein-DNA recognition / M.Yu. Zhitnikova, O.P. Boryskina, A.V. Shestopalova // NANOBIOPHYSICS: Fundamental and Applied Aspects, Third Symposium, 7 – 10 October 2013, Kharkiv, Ukraine, Book of Abstracts, p.38.
  18. Glibitskiy G.M. Textures of the films of human serum albumen // NANOBIOPHYSICS: Fundamental and Applied Aspects, Third Symposium, 7 – 10 October 2013, Kharkiv, Ukraine, Book of Abstracts, p.109
  19. Perepelytsya S.M. Texture formation in DNA films with alkalimetal chlorides / S.M. Perepelytsya, M. Glibitskiy, S.N. Volkov // NANOBIOPHYSICS: Fundamental and Applied Aspects, Third Symposium, 7 – 10 October 2013, Kharkiv, Ukraine, Book of Abstracts, p.112.
  20. Солошенко Э.Н. Исследование влияния плюс капилляр-биола на эритроциты крови человека с помощью акусто-диэлектрометрического метода / Э.Н. Солошенко, Н.В. Хмель, З.М. Шевченко, Т.П. Ярмак, В.Г. Колесников. // IV Международная междисциплинарная конференция «Биологические активные вещества и материалы: фундаментальные и прикладные вопросы получения и применения», 27 мая – 1 июнь, 2013 г., АР Крым, Новый Свет, С. 181-182.
2014 y.
 Monographs

  1. Шестопалова А. В., Житникова М.Ю., Борискина Е.П. Полиморфизм ДНК и проблема белково-нуклеинового узнавания: монография. — LAP: Lambert Academic Publishing, Saarbrucken, Germany, 2014-03-25, 112 с., ISBN 978-3-659-30140-7.
  1. Малеев В. Я. Методы биофизических исследований: монография. — Х.: ХНУ им. В.Н. Каразина, Харьков, 2014. — 457 с., ISBN 978-966-285-102-1.
  1. Evstigneev M.P., Shestopalova A.V. Structure, Thermodynamics and Energetics of Drug-DNA Interactions: Computer Modeling and Experiment, pp.21-58, In: Application of Computational Techniques in Pharmacy and Medicine; Series: Challenges and Advances in Computational Chemistry and Physics, Vol. 17; Gorb, Leonid, Kuz’min, Victor, Muratov, Eugene (Eds.), 2014, XIII, 550 p.; ISBN: 978-94-017-9256-1 (Print) 978-94-017-9257-8 (Online).

 Articles

  1. Zhitnikova M.Y., Boryskina O.P., Shestopalova A.V. Sequence-specific transitions of the torsion angle gamma change the polar-hydrophobic profile of the DNA grooves: implication for indirect protein-DNA recognition // Biomol. Struct. Dyn. – 2014. – V.32. – N 10. – pp. 1670-1685. Impact Factor = 2.983- 2013.
  2. БлизнюкЮ. Н. Самоассоциация и гидратация флавин-мононуклеотида в растворах и плёнках. / Ю. Н. Близнюк, Д. М. Глибицкий, М. А. Семёнов, А. В. Шестопалова, В. Я. Малеев // Біофізичний Вісник. – 2014. – № 31(1). – C. 5-22.
  3. Glibitskiy G.M. Fractal textures of serum albumin and Na-DNA films from solutions with metal // Биоф. Вестн. – 2014. – № 31(1). – C. 23-28.
  4. В.Е. Духопельников. Моделирование кривых теплопоглощения тройных систем лиганд-конкурент-ДНК// Биофизический вестник. Вип. 31 (1). 2014. С.49-58.
  5. А.А. Герус, А.В. Фомин, Н.А. Гладковская, Е.Г. Березняк,  Е.В. Духопельников, А.С. Хребтова, А.В. Зинченко. Влияние флавинмононуклеотида на взаимодействие в системе бромистый этидий -ДНК// Биофизический вестник, Вип. 32 (2). 2014. С.5-13.
  6. Хмель Н.В. Эффективность применения терагерцового излучения при контаминации микрофлорой смазочно-охлаждающих жидкостей // // Учёные записки Таврического национального университета им. В.И. Вернадского, «Вчені записки Таврійського національного університету», Серия «Биология, химия».- 2014.- Т.27(66), № 2.- С. 165-171.
  7. Хмель Н. В. Диэлектрическая проницаемость и поверхностное натяжение в оценке жизнедеятельности микроводорослей // Ученые записки Таврического национального университета им В.И. Вернадского, Серия «Биология, химия».- 2014.- Т. 27(66), № 4.- С. 84 – 92.

Theses

  1. Солошенко Э.Н., Колесников В.Г., Кондакова А.К., Хмель Н.В., Шевченко З.М., Ярмак Т.П. Гидратация как маркер диагностики аутоиммунной патологии. Материалы научно-практической конференции с международным участием «Международная интеграция и научные достижения украинской дерматовенерологии», г.Харьков, 2014, стр. 103 – 104.
  2. Khmel N.V., Kamenev Yu.E., Kolesnikov V.G., Khmel S.I. Effect of terahertz irradiation on microalgae permittivity as adaptation marker at working of metal-cutting compound // Interdisciplinary Scientific Conference «Adaptation strategies of the living systems», Novy Svet, AR Crimea, Ukraine, May 12–17, 2014, p. 18 – 19.
  3. Zhitnikova M.Yu. Analysis of distribution of electrostatic potential in a minor groove of DNA double helix // NANOBIOPHYSICS: Fundamental and Applied Aspects, Third Symposium, 7 – 10 October 2013, Kharkiv, Ukraine, Book of Abstracts, p.38.
  4. Glibitskiy D.M., Glibitskiy G.M., Gorobchenko O.O., Nikolov O.T., Semenov M.A. Textures of BSA films with sodium halides // International research and practice conference “Nanotechnology and Nanomaterials”, 23-30 August 2014, Lviv
  5. Pesina D.A. Hydration of complexes between sodium copper chlorophyllin and serum albumines / D.A. Pesina, O.V.Khorunzhaya, V.A. Kashpur, A.V.Shestopalova // 8th International Conference on Broadband Dielectric Spectroscopy and its Applications, Wisla, Poland, September 14-19, 2014 : programme and book of abstracts. – P-33.
  6. Глибицкий Д.М., Глибицкий Г.М. Критерий оценки воздействия биологически активных веществ на биополимеры по изменениям текстур пленок // 14th Kharkiv Young Scientists Conference on Radiophysics, Electronics, Photonics and Biophysics. Kharkiv, October 14-17, 2014. – 1 электрон. опт. диск (CD-ROM)
  7. Герус А.A. Влияние хлорофиллина на взаимодействие в системе ДНК-профлавин// 14th Kharkiv Young Scientists Conference on Radiophysics, Electronics, Photonics and Biophysics. Kharkiv, October 14-17, 2014. – 1 электрон. опт. диск (CD-ROM).
2015 y.
Monographs

  1. Термодинамика комплексообразования лигандов с нуклеиновыми кислотами в водном растворе: Монография / Е.Г. Березняк и др. – М.: Вузовский учебник:  НИЦ ИНФРА-М, 2015. – 166 с.: 60×90 1/16. – (Научная книга). (о), ISBN 978-5-9558-0417-0. Код – 334700.01.01.
  2. Zhitnikova M.Yu., Boryskina O.P., Shestopalova A. V. Nucleosome as an example of a nanosystem formation: structural dynamics of nucleosomal DNA / Chapter XX. In book: “Nanobiophysics: Fundamentals and Applications”, Pan Stanford Publishing (принято к публикации).

 Articles

  1. Кашпур В. А., Песина Д. А., Хорунжая О. В., Малеев В. Я., Шестопалова А. В. Связанная вода в комплексе ДНК–хлорофиллин // “Химия, физика и технология поверхности” “Химия, физика и технология поверхности”. – (принято к публикации).
  2. Glibitskiy G., Glibitskiy D., Gorobchenko O., Nikolov O., Roshal A., Semenov M., Gasan A. Textures of BSA films with different concentrations of sodium halides and water state in solution, «Nanoscale Research Letters», направлено в печать.
  3. Э.Н.Солошенко, А.К.Кондакова, В.Г.Колесников, Н.В.Хмель, З.М.Шевченко, Т.П.Ярмак. Исследование параметров гидратации и поверхностного натяжения плазмы крови больных ограниченной склеродермией // Дерматология и венерология, 2015.– № 1 (67).– С. (направлена в редакцию).
  4. Sorokin V.A., Usenko E.L., Valeev V.A., Berezniak E.G., Andrushchenko V.V. Interaction of Zn2+ ions with single-stranded polyU and polyC in neutral solutions // J. Phys. Chem B. (in press).
  5. Bereznyak E.G., Gladkovskaya N.A., Khrebtova A.S., Gerus A.A., Evstigneev M.P. Theoretical approaches for investigation of Drug-DNA melting thermodynamics // Therm. Anal. Calorim. (направлена в редакцию).
  6. Влияние двух типов связывания лигандов с ДНК на параметры перехода спираль-клубок в  полінуклеотидах / Гладковская Н.А., Хребтова А.С., Березняк Е.Г., Духопельников Е.В., ЗинченкоА.В. // Биофизика (на рецензировании).

Theses

  1. Pesina D.A., Khorunzhaya O.V., Kashpur V.A., Shestopalova A.V., Mallev V. Ya. Hydration of biopolymer–chlorophyllin complexes measured by microwave differential dielectrometry // 45th European Microwave Conference, Paris, France, September 6-11, 2015.

Synopsis

 Хребтова Г.С. Вплив лігандів на термодинамічні характеристики переходу спіраль-клубок у полінуклеотидах. – Автореферат дисертації на здобуття наукового ступеня канд. фіз.-мат. наук за спеціальністю 03.00.02 – біофізика. – Ротапринт ІРЕ ім. О.Я. Усикова НАН України, Харків, 20015. – 20 с.